Libreria knock-out di S. pombe

La libreria di mutanti a delezione dell’intero genoma di S. pombe (Schizosaccharomyces pombe) è stata sviluppata in collaborazione tra BIONEER, il Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology (KRIBB) e Cancer Research UK. BIONEER detiene la licenza esclusiva per l’utilizzo commerciale di questa libreria.

Questa libreria rappresenta uno strumento potente per l’analisi della funzione genica, l’identificazione di target farmacologici, studi di validazione e analisi globali delle funzioni cellulari. Può essere utilizzata anche per lo screening farmacologico e studi di espressione genica, inclusa l’analisi di letalità sintetica.

La libreria di mutanti a delezione di S. pombe è stata creata mediante ricombinazione omologa, sostituendo il gene target con una cassetta selettiva contenente KanMX4.

• La libreria di mutanti eterozigoti diploidi comprende un totale di 4.845 varianti, coprendo circa il 98% dell’intero genoma (compresi 4.914 ORF totali).

• La libreria di mutanti omozigoti aploidi comprende un totale di 3.497 varianti.

Ogni ceppo presenta un codice a barre specifico su entrambi i lati del marcatore selettivo (KanMX4), che facilita l’analisi di grandi quantità di dati per lo studio delle funzioni geniche e lo screening di target farmacologici sull’intero pool di ceppi. Inoltre, l’analisi dei profili di espressione di ciascun ceppo permette di identificare efficacemente la funzione dei geni.

I prodotti disponibili sono:

- Primary Test Service in Wild Type S. pombe (5 strain) [GPS-00]

Una tecnologia innovativa per l’identificazione dei target farmacologici basata sull’haploinsufficienza indotta da farmaci (Drug-induced Haploinsufficiency, DIH), utilizzando la prima libreria mondiale di mutanti eterozigoti a delezione dell’intero genoma del lievito a divisione fissione S. pombe. 

L’identificazione accurata del target farmacologico è il primo e più cruciale passo non solo per aumentare il tasso di successo nello sviluppo di nuovi farmaci, ma anche per comprendere il meccanismo d’azione, migliorare l’efficacia, e tracciare ed evitare effetti collaterali. Bioneer ha sviluppato un nuovo sistema di screening ad alto rendimento e a livello genomico chiamato GPScreen™-FAST, reso disponibile commercialmente per i ricercatori impegnati nella scoperta di nuovi farmaci.

Questa tecnologia copre un ampio spettro di candidati farmaci in diverse aree terapeutiche, dalle malattie oncologiche e metaboliche fino a malattie rare e trascurate. Fornisce una soluzione completa per una scoperta di farmaci efficiente, offrendo risposte chiare a problematiche come l’identificazione del/i target farmacologico/i, la tossicità e i meccanismi d’azione dei candidati farmaci.

GPScreen™-FAST si basa sulla libreria genomica di mutanti a delezione di S. pombe, sviluppata congiuntamente da Bioneer e dal Korea Research Institute of Bioscience & Biotechnology (KRIBB) in collaborazione con il Dr. Paul Nurse del Cancer Research Center UK (Nat. Biotech, 28, 617–623, 2010). Bioneer detiene i diritti esclusivi commerciali su questa libreria e la mette a disposizione per screening genetici e chimici, come l’identificazione di target farmacologici, il profiling dell’espressione genica e il profiling di letalità sintetica.

La libreria genomica copre circa il 98,5% dell’intero genoma del lievito a divisione fissione S. pombe. Le varianti individuali sono ceppi in cui uno dei due alleli di un gene è stato disattivato mediante l’inserimento di una cassetta con codice a barre DNA tramite ricombinazione omologa (come mostrato nell’immagine). Tutti i ceppi crescono in equilibrio e vengono raggruppati in pool, quindi il loro codice a barre viene analizzato mediante sequenziamento di nuova generazione (NGS) per valutare la risposta ai farmaci.

- S. pombe Genome-wide Heterozygous Deletion Mutant Screening Service [GPS-01-GW] 

Una tecnologia innovativa per l’identificazione di target farmacologici utilizzando l’Insufficienza Haploide Indotta da Farmaci (DIH) nella prima libreria al mondo di mutanti eterozigoti a delezione dell’intero genoma del lievito di fissione S. pombe.

- S. pombe Validation Primer set ver 3.0 to ver 5.0 Upgrade Pkg (940 primers) [M-3030P-U5]

Questo prodotto è composto da 2 set da 940 primer ciascuno. Viene utilizzato per confermare la qualità dei mutanti a delezione aploidi di S. pombe dalla versione 3.0 alla versione 5.0 tramite PCR. Contiene una miscela di un primer specifico per il gene target e un primer comune per il modulo KanMX, una cassetta di delezione, permettendo così di preparare facilmente la miscela per la PCR con una sola pipettata.

- S. pombe Validation Primer set ver 3.0 to ver 4.0 Upgrade Pkg (278 primers) [M-3030P-U4]

Questo prodotto è composto da 2 set da 278 primer ciascuno. Viene utilizzato per confermare la qualità dei mutanti a delezione aploidi di S. pombe dalla versione 3.0 alla versione 4.0 tramite PCR. Contiene una miscela di un primer specifico per il gene target e un primer comune per il modulo KanMX, una cassetta di delezione, permettendo così di preparare facilmente la miscela per la PCR con una sola pipettata.

- AccuOligo® S. pombe Validation Primer Set Ver 3.0 (3,308 primers) [M-3030P]

Questo prodotto è composto da 2 set da 3.308 primer ciascuno. Viene utilizzato per confermare la qualità dei mutanti a delezione aploidi di S. pombe versione 3.0 tramite PCR. Contiene una miscela di un primer specifico per il gene target e un primer comune per il modulo KanMX, una cassetta di delezione, permettendo così di preparare facilmente la miscela per la PCR con una sola pipettata.

- S. pombe Haploid Deletion Mutant Set ver 6.0 5Y License (3,497 strains) [M-6030H-5Y]

- S. pombe Deletion Mutant Individual Strains